Conforme o descritivo do Brasão da Cidade: "a faixa prateada representa o Rio Preto e o Tubarão simboliza o nome do Município, já que Peruíbe é corruptela de Iperuiybe, que na língua indígena dos nossos antepassados, significa Rio do Tubarão."

Porém, diversas versões e suposições a respeito da origem do nome Peruíbe foram levantadas pelos historiadores, uma delas é a saudação dos meninos indígenas que ao receber os portugueses diziam Pêro – Yba, que dizem em Tupi significar "Seja bem vindo".

Outros sustentam a hipótese de que a denominação estaria relacionada ao nome de um cacique da aldeia dos índios Pátria dos Tapuias, sendo seu principal cacique conhecido por Piriri Goa Ob Yg.

Padre Anchieta batizou os primeiros índios catequizados, dentre elas Antônia, bisneta de Piqueroby, o célebre maioral de Ururahy.

Em consulta ao Prof. Joubert Di Mauro autor do livro "Vocabulário Português-Tupi", o mesmo respondeu que Peruíbe é corruptela de Peruhibe e, originalmente, é Ipirú-y-be e significa "no rio do tubarão".

Consta, também, de alguns documentos que esse nome estaria associado ao modo como José de Anchieta se referia ao lugar, chamando-o de Tapirema do Peru, por suas semelhanças com a região peruana, onde os jesuítas haviam enfrentado dificuldades no exercício da catequese.

O nome Peruíbe até hoje é uma incógnita, não existindo uma tradução segura do mesmo.