Das formações quaternárias da baixada do Ribeira destaca-se um pontão rochoso, a Ponta da Juréia, com orientação leste - oeste, avançando para o mar e, paralelamente, aparecem outros pontões: Ponta do Grajaúna e Ponta do Una.

Separado pela Serra do Mar e se destacando na paisagem da região, o Maciço da Juréia se apresenta como um afloramento do complexo cristalino pré-Cambriano, pertencente ao escudo atlântico. Chega a atingir 869 metros de altitude, sendo uma característica relevante a formação de dois altos espigões, por ser bipartido, resultando na convergência de águas no vale formado entre eles, criando belas quedas d'água, como a Cachoeira do Guilherme.

Participando do conjunto da Serra do Mar, tem-se ainda a área escarpada da Serra dos Itatins, que possui abruptas vertentes, com inclinação superior à 30O, formando penhascos como o Dedo de Deus, a Serra do Bananal, o Maciço do Guaraú e a Ponta do Juquiá.

A topografia de Peruíbe no perímetro urbano é de característica plana, abrangendo o centro da cidade e o interior, no sentido leste. Apresenta alguns trechos alagadiços e também uma faixa de manguezal que, em pequena escala, acompanha as margens dos rios. Há, ainda, uma topografia acidentada, calculada em 60% da área do município, caracterizada pela presença de montanhas, como a Serra do Itatins, onde estão os divisores de água da região

Altitudes dos Pontos Mais Altos na Região

Nome	Município	Altitude (em metros)
Três Pontas	Peruíbe	1.372
Pico Dedo de Deus	Iguape	1.333
Ponta de Parnapuã	Peruíbe	508
Pico de Itatins	Peruíbe	500
Morro do Guatiaia	Peruíbe	359
Morro do Grajaúna	Iguape	338
Morro do Maceno	Peruíbe	300
Ponta do Guaraú	Peruíbe	287
Pedra do Pogoça	Iguape	208
Ponta da Juréia	Iguape	160
Morro da Pescaria	Peruíbe	100
Morro dos Prados	Peruíbe	77
Morro Patrapuã	Peruíbe	72

A origem da Juréia e da região de entorno, remontam ao período Cretáceo, época em que as rochas pré-cambrianas, já metamorfoseadas, foram cortadas por falhamentos, formando escarpas e espigões, que são cobertas por vegetação predominantemente lenhosa.

As áreas de planícies tiveram origem no recuo irregular do maciço, além da deposição de sedimentos por parte dos rios, a vegetação das planícies é composta de licinas e epífitas, que revestem os troncos; o extrato mais próximo do solo é ocupado principalmente por brotos e plantas jovens, havendo a ocorrência de outras espécies, como plantas arbustivas, em menores quantidades, e os líquens que povoam todos os níveis.

Porta de Pedra

Localizada na estrada Peruíbe / Guaraú, na altura do 1,5 km, é uma formação rochosa granítica, onde salienta-se um "pedrão" rochoso. Trata-se de uma conformação que se eleva do solo e, no topo, forma um arco bastante simétrico, retornando numa linha paralela ao chão, formando a figura de uma porta incrustada na rocha. Pode-se imaginar até uma espécie de porta balcão, em estilo colonial. Algumas pessoas dizem que este local sugere sensações místicas, e outros afirmam tratar-se de algo com o fim específico de recepcionar seres extraterrestres.