Dentre os sítios arqueológicos de Peruíbe, destacam-se as Ruínas do Abarebebê e as Ruínas do Guarauzinho, que são consideradas como um dos elementos históricos de maior potencial turístico do município.

Ruínas do Guarauzinho: Na praia do Guarauzinho existem ruínas remanescentes de edificações em pedra bruta que, na época colonial, sustentavam a morada do então escravista Pêro Corrêa, sesmeiro daquelas terras, que usava o local como base para aprisionar índios que posteriormente eram negociados e enviados para a Europa. A ilha do Guaraú, que fica defronte as atuais ruínas, era usada como ancoradouro das naus para o transbordo dos índios negociados. Registra a história que Pêro Corrêa abandonou a atividade escravista após converter-se cristão novo por volta de 1553, quando doou suas terras à Companhia de Jesus. Chega-se ao local, usando-se inicialmente, a estrada Peruíbe – Guaraú de onde deve-se atravessar o rio.

Sambaqui do Guaraú: Encontra-se dentro da E.E.J.I., na Ilha Fluvial do Rio Guaraú. Sofreu exploração parcial com a retirada de conchas para a produção de cal

Ruínas da Fazenda São João: Possui material arqueológico, com fragmentos de cerâmica neobrasileira, faiança portuguesa do século XVIII ou XIX e fragmentos de cachimbo de barro, dentre outros; : Ruínas com estrutura em pedra e barro. Pode tratar-se de uma antiga habitação, engenho ou alambique, correspondendo o local ao "Sítio do Villão", podendo ser datada do século XVIII.

Sítio Piaçaguera I: Constitui-se parte da área do Taniguá: Área de mineração situada no lado norte do município possui uma estação férrea denominada Taniguá, é considerado corredor de fauna, onde observa-se a praia, a vegetação de restinga, a várzea e a mata atlântica. Neste local ainda se observam vestígios de cacos de louça da Estrada do Telégrafo (importância histórica), cerâmicas indígenas e urna funerária indígena. É um local pouco freqüentado, apresentando características naturais preservadas. Foi bastante populoso até o início do século onde, atualmente, existe uma pequena igreja na qual, indígenas e brancos realizavam festas religiosas e comunitárias. Segundo relatos, Taniguá foi o início do povoado de Peruíbe.

Existem mais dois sítios arqueológicos que estão cadastrados no Instituto do Patrimônio Histórico e Artístico Nacional. Há no local peças de cerâmica neobrasileira.

Sítio Piaçaguera II: Possui fragmentos de cerâmica indígena e neobrasileira, além de faiança portuguesa (louça de barro esmaltado ou vidrado) do século XVII ou XVIII e alguns poucos fragmentos de telha colonial.

Sítio Piaçaguera III: Merece destaque pela quantidade de conchas que possui, além de fragmentos de cerâmica neobrasileira.

Ruínas do Abarebebê: A Igreja do Abarebebê é identificada com a primeira construída no Brasil, sendo erguida por volta do século XVI. O sítio arqueológico guarda em seu promotório as ruínas da antiga igreja.

Ponte do Rio Guaraú: Há poucas informações e estudos precisos sobre a ponte, que se encontra, atualmente, em estado de ruínas, sendo sua base construída em pedra e cal.